Τα δύο μικρότερα ΜΤ, τα ΜΤ-125 και ΜΤ-03 δέχτηκαν επίσης κάποιες μικρές αλλαγές ακολουθώντας τα υπόλοιπα μοντέλα της γκάμας.
Το 2025 δεν είναι μια χρονιά ριζικών αλλαγών για το 125άρι και το "300άρι" MT με τη Yamaha να περιοριζεται για την περίπτωσή τους στα απολύτως απαραίτητα.
Για τη νέα χρονιά η Υamaha επίφύλαξε για το MT-03 ένα μικρό ρετούς, το οποίο και εντοπίζεται στα ανασχεδιασμένα πλαστικά της ουράς του, ενώ ελαφρώς διαφορετική παρουσιάζεται στο τελείωμά της και η σέλα του συνεπιβάτη.
Επίσης, η LCD οθόνη του προσφέρει πλέον και υποτυπώδη συνδεσιμότητα με κινητό, με τον αναβάτη να λαμβάνει ειδοποιήσεις για εισερχόμενες κλήσεις και μηνύματα.
Από την άλλη το MT-125 προσφέρει πλέον περισσότερη συνδεσιμότητα με smartphone και η Yamaha αναφέρει ότι τώρα η οθόνη του μπορεί να προβάλλει και πλοήγηση στροφή-στροφή, ενώ προσφέρετε και έλεγχος μουσικής αλλά και πληροφορίες για τον καιρό.
Κοινές αλλαγές και στις δύο μικρού κυβισμού μοτοσυκλέτες της Yamaha είναι η συμμόρφωση των κινητήρων τους με τις προδιαγραφές Euro 5+ όπως και το νέο χρώμα "Ice Storm" με το οποίο θα είναι διαθέσιμα, με ανοιχτό μπλε χρώμα για τις ζάντες και πολύ ανοιχτό γκρι για τα πλαστικά και το πάνω μέρος του LED φωτιστικού σώματος.
